抗原間的相互關系分為三種，分別是互斥關系、子代與親代的關系和共表達關系。

互斥關系是指兩種抗原不會同時表達在一中細胞上，即表達A不表達B，表達B不表達A。配色時，互斥的抗原是允許熒光溢漏的。

子代與親代關系是指抗原之間是上下級關系，即下級抗原是在上級抗原的基礎上進行分析的。

共表達關系是指兩種抗原同時表達在一種細胞上。配色時，共表達抗原要搭配熒光干擾較小的熒光素，盡量避免熒光溢漏。

什么樣的抗原屬于共表達抗原呢？以Treg細胞為例，Treg細胞同時表達CD25和Foxp3，那么CD25和Foxp3就屬于共表達關系。在這種情況下，CD25和Foxp3需要搭配相互之間沒有溢漏的熒光素，比如搭配APC和PE，因為這兩個熒光素是幾乎沒有干擾的，因此可獲得預期的數據結果。

在多色流式實驗中，如果兩個共表達Marker使用的熒光染料之間干擾較嚴重，則會對圈門造成干擾，影響實驗結果的準確性。雖然我們也能通過調節(jié)補償來減少光譜重疊的影響，但對被干擾通道熒光靈敏度降低的影響是無法通過后續(xù)的結果分析來消除的。

如果共表達抗原之間有嚴重熒光干擾會怎么樣呢？那結果就可能出現如上圖右所示的情況，雖然進行了補償調節(jié)，但得到的目的細胞的比例跟實際有差別。